A Fundação Educacional João XXIII diferencia-se por ser a única escola comunitária do Rio Grande do Sul, com uma gestão compartilhada entre educadores e famílias e sem fins lucrativos. Como marca da sua história, encontra-se a proposição de reflexão sobre temas emergentes da Educação.
Assim, propõe-se pensar num continuum, desde o último seminário, intitulado Educação em Tempos de Conflito, que marcou seus 55 anos e promoveu uma imersão sobre os riscos e desafios da Educação no momento histórico brasileiro que se vivia. O encontro reuniu palestrantes de renome nacional e internacional e propôs uma corajosa e profunda análise sobre os riscos e desafios da Educação em 2019, sendo aberto para instituições de ensino e sindicatos. Além dos debates, o seminário ofereceu momentos de arte e abriu espaço para a fala dos estudantes. A organização das propostas produzidas durante o evento resultou em um “Manifesto pela Educação”. O documento foi encaminhado aos organismos ligados ao setor, configurando um legado do Colégio João XXIII à Educação brasileira ameaçada por reformas redutoras e retrógradas.
Desde então a Escola revisitou seus documentos legais, atualizando seus princípios, destacando-se entre eles a Educação Cidadã e Democrática e a Inclusão Social e Racial, por meio da erradicação de preconceitos, discriminações e iniquidades, e a Pluralidade, respeitando e valorizando diferenças. A nossa trajetória já era marcada pela inclusão social por meio de bolsas de estudos para crianças e jovens. Cabe destacar que, desde 2020, a Escola possui um Coletivo Antirracista. Com o início do Coletivo, novas e potentes ações se articulam no cotidiano: política de contratação de profissionais negros, pardos e indígenas, formações para toda a comunidade escolar, Projeto João de Todas as Cores, que oferece bolsas de estudo para crianças e jovens negros, pardos e indígenas, entre outras ações em prol da construção de uma comunidade antirracista.
Atualmente o Coletivo Antirracista possui uma Comissão, com representações da comunidade, que projeta e realiza ações em prol da construção de uma Escola Antirracista. Ressaltamos também que, em 2024, foi formalizada a Comissão João Inclusivo, formada por famílias do AEE (Atendimento Educacional Especializado) e outras representações da Escola. A Comissão tem o propósito de debater e projetar ações na construção de uma Escola para todas as crianças e jovens.